公司内部审计的流程通常包括以下几个步骤：
计划审计
确定审计目标和范围。
评估相关风险。
制定审计计划和时间表。
准备工作
收集企业背景信息，包括政策、程序、流程等。
确定审计准则和标准。
定义审计团队的组成和角色。
实施审计
收集证据，可能包括文件审查、访谈、观察和测试。
评估内部控制的有效性。
检查合规性，确保企业运作符合相关法律、法规和内部政策。
分析数据
对收集到的数据进行分析。
识别潜在的问题、风险和不足。
报告审计结果
准备审计报告，概述发现和建议。
报告给企业的相关管理层或董事会。
后续追踪（后续程序）
确保管理层对审计发现采取行动。
评估和监控改进措施的实施效果。
完成审计
关闭审计项目，确认所有审计工作都已完成。
审计文件归档，以备将来的参考或复查。
此外，还有一些具体的操作细节和注意事项：
编制内审计划：内审计划应包括内审的目的、范围和内容、依据和标准、内审小组组成、内审时间安排等。内审计划由质量管理部编制，质量负责人审核，主要负责人批准。
编制检查表：质量管理部负责人应根据内审计划组织质量管理部编制内审检查表，作为内审现场检查的标准。检查表可以根据行业内的法律法规或认证检查项目编写。
召开首次会议：内审组长应组织开展内审首次会议，向内审小组全体成员和受审核部门人员传达内审的详细安排、内审的流程以及需要配合和注意的事项。首次会议应记录并存档。
现场审计：内审员按照内审标准对受审部门以提问、查阅资料及记录、现场检查等方式，逐项审核、评价，如实、准确、完整记录审核内容及发现的问题。各组审计人员认真记录并当天把内审缺陷项目报给质量管理部门负责人。
汇总缺陷项：内审员在审计过程中发现的问题应汇总，并在审计结束后形成缺陷项报告，提交给质量管理部门负责人。
后续追踪：审计结束后，应确保管理层对审计发现的问题采取相应的纠正措施，并跟踪验证这些措施的实施效果，以确保问题得到彻底解决。
通过以上步骤和注意事项，公司内部审计可以系统地评估和监督企业的运营、风险管理、内部控制和财务报告过程，从而提升企业的运营效率和合规性。