医师资格证注册通常需要前往所在地县级以上地方人民政府卫生行政部门进行办理。具体注册机构一般是当地的卫生健康委员会或其指定的特定机构。您可以通过以下步骤进行医师资格证的注册：
电子化注册
访问国家卫健委电子注册网站：[国家卫健委](https://www.cndocsys.cn/home/index)。
在个人端进行注册，并等待上级审核。
审核通过后，根据指示进行信息确认，并提交必要的纸质材料。
纸质材料提交
准备相关材料，如医师执业注册申请审核表、医师资格证书、健康体检表、身份证明等。
将材料提交至当地卫生健康委员会或其指定的注册机构。
注意事项
医师变更执业地点、执业类别、执业范围等事项，也需在相应的卫生健康主管部门办理变更注册手续。
执业医师可以在不同省份同时注册执业地点，但一个执业地点下只能有一个主要执业机构。
如果在获得资格后两年内未注册，可能需要接受指定机构的培训并通过考核后才能申请注册。
请根据您所在地的具体规定和流程进行操作，若有疑问，可咨询当地卫生局获取详细信息。